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T4 GP45 Clamp Protein

簡要描述:

T4 GP45 Clamp Protein公司正在出售的產(chǎn)品:中國倉鼠X小鼠B淋巴細胞雜交瘤 β-內(nèi)啡肽/β endorphin封閉多肽 細粒棘球絳蟲PCR檢測試劑盒 大鼠維生D2(VD2)ELISA試劑盒 土壤錳過氧化物(SMnp)活性比色法檢測試劑盒 弗氏中華根瘤菌; (弗雷德氏中華根瘤菌 .. 脊柱側(cè)后凸畸形肽抗體

更新時間:2024-01-14

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T4 GP45 Clamp Protein

商品屬性:

產(chǎn)品名稱

規(guī)格

貨號

T4 GP45 Clamp Protein

50 ug

A-PJ1140

描述:

T4 噬菌體復制分為依賴于起始子的起始復制和依賴于重組酶的復制。由起始復制產(chǎn)生的 3’-ssDNA 作為重組復制的第一步鏈侵入的組份,該 3’-ssDNA 被 T4 gp32蛋白所覆蓋,同時將 T4 UvsY 募集到此;T4 UvsY 作為T4 UvsX 的 loader 將其運載至此,于此同時 gp32 被置換下來, UvsX 和 UvsY 形成突觸結(jié)構(gòu), 然后侵入同源的雙鏈形成 D-Loop, 一旦形成 D-Loop, UvsX 即被置換下來。D-loop 被置換鏈作為滯后鏈合成的模板,很快被gp32 結(jié)合。隨后, 解旋酶 loader gp59 與 gp32 覆蓋的DNA 復制叉結(jié)合,將 gp41/61 運載至此, gp61 蛋白合成寡核苷酸片段促進滯后鏈 DNA 的合成,而 gp41 通過解旋模板而促進先導鏈的 DNA 合成。最后,聚合酶的滑板蛋白 gp45 和其 loder 蛋白 gp44/62 與先導鏈相結(jié)合,促進聚合酶 gp43 的組裝,gp45 將 gp43 運載至復制叉處后啟動先導鏈和滯后鏈的合成,gp44/62 隨后從復制叉處解離。因此, gp45 作為聚合酶 gp43 的 loader 在 gp43引導的 DNA 合成中起到重要作用。

儲存:-20℃。
Storage Buffer:
20mM Tris-HCl,pH7.5
200mM NaCl
5mM DTT
25% Glycerol

QQ截圖20240110094643.jpg


PCR實驗中應該注意的問題有哪些?

沒有ct值

檢測結(jié)果遇到?jīng)]有Ct值情況,排查是否有以下問題:

1、循環(huán)數(shù)不夠(一般不超過45循環(huán),不僅背景值提高,定量也不準);

2、PCR程序設置錯誤,檢測熒光信號的步驟有誤。一般SG法采用72℃延伸時采集,TaqMan法則一般在退火結(jié)束時或延伸時采集信號,另外熒光采集是否選中;

3、引物或探針降解??赏ㄟ^PAGE電泳檢測引物和探針是否降解;

4、模板量可能降解或上樣量不足(不超過500ng,根據(jù)試劑盒說明書即可), 對未知濃度的樣本應從系列稀釋樣本的最高濃度做起;如果發(fā)生模板降解,應考慮樣本準備中雜質(zhì)的引入及反復凍融的情況,建議將模板樣本小量分裝儲備,避免反復凍融;

5、引物探針是否合適(尤其是引物跨越內(nèi)含子,以確保擴增基因組DNA;上下游引物Tm值超過4℃以上也會影響擴增)。

ct值過晚

在相對定量中, Ct值一般控制在15—25之間比較好,如果在絕對定量中, 對低拷貝數(shù)的樣品,Ct值會增大, 但是一般不宜超過40循環(huán), 否則定量不準確。

因此,判斷Ct值出現(xiàn)過晚是否屬于非正常情況, 需要根據(jù)具體實驗設計和目的進行。

1、擴增效率低。引物之間或者引物和探針的比例不合適, 需要進行優(yōu)化;引物或探針設計不合理, 需要重新設計;

2、PCR程序不合適, 改用三步法進行反應, 或者優(yōu)化退火/延伸溫度, 可以適當降低退火溫度; 退火/延伸時間短(可以在推薦的時間條件下延長10s);

3、MgCl2濃度不合適,增加鎂離子濃度等。PCR各種反應成分的降解或加樣量的不足;

4、PCR產(chǎn)物太長。PCR產(chǎn)物設計超過500bp;

5、模板中存在抑制物。用高純度模板進行PCR檢測或?qū)⒛0暹M行稀釋。

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PCR基本步驟及注意事項?

一、實驗原理

PCR是體外人工選擇性擴增DNA的一種方法,它類似于生物體內(nèi)DNA的復制。在生物體內(nèi)DNA復制需要模板、引物、DNA聚合酶、DNA解旋酶、 dNTPs;而體外PCR反應同樣需要類似的成分,有模板、引物、PCR Buffer、Taq酶、dNTPs。其中引物是人工設計的特定序列,實現(xiàn)對特定位置的擴增;PCR Buffer提供一個反應的緩沖環(huán)境;反應過程同生物體內(nèi)一樣,DNA雙鏈打開,引物結(jié)合模板,延伸形成新鏈。而這些過程在生物體內(nèi)靠DNA解旋酶解鏈,而在體外在通過控制反應溫度實現(xiàn)的。如常用94℃變性模板DNA打開雙鏈,在退火溫度處引物結(jié)合到模板上,最后在72℃完成延伸,并反復重復此過程即可實現(xiàn)對特定片段DNA的大量擴增。到第三循環(huán)開始才產(chǎn)生出和靶DNA區(qū)段相同的DNA分子,進一步循環(huán)地產(chǎn)生出靶DNA區(qū)段的指數(shù)加倍。

在擴增后期,由于產(chǎn)物積累,使原來呈指數(shù)擴增的反應變成平坦的曲線,產(chǎn)物不再隨循環(huán)數(shù)而明顯上升,這稱為平臺效應。平臺期(Plateau)會使原先由于錯配而產(chǎn)生的低濃度非特異性產(chǎn)物繼續(xù)大量擴增,達到較高水平。因此,應適當調(diào)節(jié)循環(huán)次數(shù),在平臺期前結(jié)束反應, 減少非特異性產(chǎn)物。到達平臺期(Plateau)所需循環(huán)次數(shù)取決于樣品中模板的拷貝。

二、主要的成分

1.模板可以是多種形式,主要包括基因組DNA、質(zhì)粒DNA、攜帶病毒的基因組DNA、PCR產(chǎn)物,cDNA等,但不能為RNA。對于不同類型的模板,其主要不同在于預變性的時間以及模板的量。一般對于大的基因組DNA預變性時間10min足夠,質(zhì)粒DNA2min、攜帶病毒的基因組DNA預變性2min、PCR產(chǎn)物預變性2min即可。

注意cDNA為單鏈DNA,但仍可做PCR的模板,只不過在第一輪循環(huán)時只有一個引物結(jié)合,合成另一條鏈。從第二輪開始,兩個引物均與特異位點結(jié)合,從而實現(xiàn)了與常規(guī)PCR的接軌。而同作為單鏈的RNA卻不能進行PCR擴增,原因就在于實現(xiàn)PCR反應的是DNA聚合酶,只能特意識別DNA鏈。

2.對于模版的量來說,一般25ul體系DNA的質(zhì)量為50—100ng。對于基因組DNA由于其結(jié)構(gòu)比較復雜,提取的濃度也往往比較大,為防止?jié)舛冗^大對PCR造成影響,故需對提取的DNA進行梯度稀釋。否則濃度過高則可能會引起非特異性擴增。對于質(zhì)粒及PCR產(chǎn)物由于其結(jié)構(gòu)簡單,且提取濃度一般較低,則無需稀釋。

公司正在出售的產(chǎn)品:

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T4 GP45 Clamp Protein馬皰疹病毒4型探針法熒光定量PCR試劑盒

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人單核細胞增多性李斯特菌O((LLO) ELISA檢測試劑盒

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